ỨNG DỤNG GIẢI TRÌNH TỰ THÉ HỆ MỚI ĐẺ PHÂN TÍCH ĐỌT BIÉN GEN TRONG HỘI CHỨNG ROI LOẠN SINH TUY

Minh Phương Vũ

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Mục tiêu: Ứng dụng giải trình tự thế hệ mới (Next Generation Sequencing - NGS) để phân tích đột biến của 4 gen: SF3B1, TET2, ASXL1 và DNMT3A trên bệnh nhân hội chứng rối loạn sinh tùy (Myelodysplastic Syndrome - MDS). Phương pháp: 9 bệnh nhân MDS được chần đoán theo tiêu chuẩn của WHO 2016; đang theo dõi điều trị tại Khoa bệnh máu tổng hợp, Viện Huyết học - Truyền máu TW. Nghiên cứu mô tả cắt ngang; xây dựng quy trình giải trình tự gen SF3B1, TET2, ASXL1 và DNMT3A trên hệ thống NGS. Kết quả: Ứng dụng thành công quy trình giải trình tự NGS cho 4 gen: SF3B1, TET2, ASXL1 và DNMT3A trên 9 bệnh nhân MDS. Nghiên cứu này đã phát hiện được 3 đột biến dừng khung đọc trên gen TET2 (c.1720C>T, c.4393C>T, c.4824T>A), 1 đột biến dịch khung đọc trên gen ASXL1 (c.1681_1682insT), 1 đột biến sai nghĩa (c.1585G>A) và 2 đột biến dịch khung đọc trên gen DNMT3A (c.634_637delAGGG, c.1393_1394insG). Trong đó, 1 trong 3 đột biến gen TET2 (c.4824T>A), 1 đột biến biến gen ASXL1 (c.1681_1682insT) và cả 3 đột biến gen DNMTЗА (c.1585G>A, c.634_637delAGGG, c.1393_1394insG) là những đột biến mới chưa từng được công bố trên các cơ sở dữ liệu. Ngoài ra, nghiên cứu cũng phát hiện được 2 biến đổi di truyền mới trên gen TET2 (c.4538A>G, c.4540C>A), 1 biến đổi di truyền mới trên gen ASXL1 (c.3221A>C) và 2 biến đổi di truyền mới trên gen DNMT3A (c.1390A>G, c.1069G>A). Những đột biến mới phát hiện có thể giúp các bác sỹ trong việc hỗ trợ chẩn đoán và đánh giá tiên lượng cho bệnh nhân MDS. Kết luận: Giải trình tự gen thế hệ mới là công cụ hữu ích để phân tích các biến đổi di truyền gây bệnh ở những gen đặc trưng đã biết; hỗ trợ bác sỹ trong chẩn đoán và xếp loại nguy cơ cho bệnh nhân rối loạn sinh tủy.

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo